伪狂犬病病毒潜伏的主要部位为三叉神经、嗅球和扁桃体。口鼻感染后，病毒首先在上皮组织复制或直接进人鼻咽部感染神经元的神经末梢。经第一轮复制后，子代病毒大量产生，导致大量的初级神经元被感染。病毒在三叉神经的定居与再感染之间有一定联系，潜伏伪狂犬病病毒的神经元，不可能接受伪狂犬病病毒其他毒株的再感染（即“占位效应”）。这些结果表明，致弱的活疫苗可以建立潜伏期去抑制野毒株的感染，这也是强调必须免疫的理由。